I casi di COVID stanno aumentando di nuovo a causa della sottovarianza di Omicron, la ricerca mostra che i campioni del test PCR possono provenire dalla saliva

2022-07-23 12:48:47 By : Ms. Ethel Zhang

Ricercatore e docente, Università Cattolica Atma Jaya dell'IndonesiaMaria Mardalena Martini Emperor ha ricevuto finanziamenti dalla Direzione Generale dell'Istruzione Superiore e della Tecnologia e ha ricevuto supporto materiale dalla Facoltà di Medicina e Scienze della Salute UNIKA Atma Jaya, PT.Indonesian Research Nalagenetik, PT Genecraft Labs Indonesia, PT ORCA Biotechnology Nusantara, PT.Pyridam Farma nell'attuazione di questo programma di implementazione della ricerca e servizio alla comunità.L'Università Cattolica Atma Jaya dell'Indonesia fornisce supporto come partner di supporto di The Conversation ID.La tendenza al ribasso dei casi di COVID-19 in Indonesia dallo scorso marzo – dopo aver raggiunto un picco a metà febbraio – non è durata a lungo.Ora, le sottovarianti di Omicron, BA.4 e BA.5, sono una nuova minaccia in questo paese.In meno di due mesi, i casi di COVID sono raddoppiati dai circa 360 casi del 1 giugno ai 4.500 casi del 17 luglio.Nel bel mezzo del picco dei casi, l'attuazione dei protocolli sanitari è sempre più importante per mantenere la sicurezza di te stesso e di chi ti circonda.Un modo per controllare la diffusione dell'infezione da COVID-19 è l'esame situazionale di SARS-CoV-2.Lo standard più utilizzato per l'esame del COVID-19 è il test PCR che utilizza campioni prelevati da tamponi nasali e orali (tamponi NPOP).Tuttavia, questo processo di prelievo dei campioni di tampone provoca spesso disagio e può essere traumatizzante.In alternativa, la nostra recente ricerca ha dimostrato che i campioni per i test PCR possono essere raccolti raccogliendo saliva o saliva in modo indipendente.Oltre a rendere il processo più facile e comodo per gli adulti, questo metodo è più amichevole per i bambini, almeno per gli studenti delle scuole elementari nel nord di Giacarta che hanno sperimentato l'applicazione di questa ricerca.Inoltre, ci sono diversi vantaggi del campionamento della saliva rispetto alle cavità nasali e orali.Il governo ha consentito ai dipendenti di lavorare negli uffici e ha implementato un sistema di apprendimento in presenza (PTM) per il settore dell'istruzione.Questa politica pone il rischio della formazione di cluster COVID-19 negli uffici e nelle scuole.Una soluzione consiste nell'eseguire esami di routine tramite il laboratorio con campioni di saliva raccolti in modo indipendente.Lo abbiamo implementato in diverse scuole elementari nel nord di Giacarta dopo circa cinque mesi dall'inizio del PTM limitato alla fine di agosto 2021. Chiediamo agli studenti di raccogliere la saliva in modo indipendente nei tubi forniti.Quindi, il campione viene inviato al laboratorio ed esaminato mediante PCR.Siamo riusciti a raccogliere 588 campioni di saliva nel dicembre 2021. Da quel campione, abbiamo riscontrato un caso positivo di infezione da SARS-CoV-2, il che significa che ha un tasso di positività dello 0,2%.Il nostro campione successivo è stato prelevato in una scuola a metà febbraio 2022. Il nostro team ha trovato tre casi su 77 campioni raccolti (tasso di positività del 4%) e campioni all'inizio di marzo 2022 hanno trovato due casi su 98 campioni (tasso di positività del 2%).Durante la raccolta dei campioni, gli studenti delle elementari hanno dichiarato di non aver riscontrato alcuna difficoltà o disagio.Quando viene riscontrato un caso positivo, agli educatori viene chiesto di risalire immediatamente alla famiglia e ai sospetti contatti stretti.Questo per prevenire la formazione di un cluster COVID-19.I controlli di routine con campioni di saliva che facciamo ottengono anche ottimi riscontri dagli educatori e dai genitori degli studenti.La raccolta di campioni COVID-19 basati sulla PCR richiede generalmente che un operatore sanitario inserisca un tampone nel tratto respiratorio.Oltre al disagio, l'attività di campionamento aumenta anche il rischio di trasmissione agli operatori sanitari.Pertanto, i campioni di saliva che possono essere raccolti in modo indipendente rappresentano un'alternativa più conveniente e riducono il rischio di trasmissione.La nostra ricerca ha dimostrato che la saliva processata con il metodo della PCR diretta, effettuata direttamente utilizzando il campione, è più veloce perché viene processata senza passare per la fase di estrazione del materiale genetico virale.Sulla base della nostra ricerca, l'esame COVID-19 basato sulla PCR con campioni di saliva ha una percentuale di corrispondenza del 97% dei risultati rispetto ai tamponi della cavità nasale e orale.Clinicamente, la Food and Drug Administration (FDA) degli Stati Uniti ha approvato l'uso di campioni di saliva come alternativa.Pertanto, oltre ai controlli di routine e alle esigenze dei viaggiatori a lunga distanza, questo metodo può essere applicato anche negli ospedali.Oltre a offrire comodità ai pazienti e agli operatori sanitari, la saliva che viene elaborata utilizzando il metodo della PCR diretta può far risparmiare costi e tempo in base allo sviluppo effettuato dal nostro team.Semplicemente riscaldando la saliva a una temperatura di 95°C per 10 minuti come processo di inattivazione del virus, il campione è pronto per essere processato nella fase di PCR.Pertanto, l'esame può essere completato in un arco di 1-2 ore.Inoltre, si stima che questo metodo possa far risparmiare un terzo del costo totale dell'esame perché non richiede reagenti di estrazione per ottenere materiale genetico virale.La maggior parte dei laboratori di test COVID-19 affiliati al Ministero della Salute sono concentrati nelle grandi città.Questo può essere superato inviando campioni da aree remote al centro della città per l'elaborazione.I campioni salivari erano abbastanza stabili per un massimo di cinque giorni a temperatura ambiente per l'esame di SARS-CoV-2.Tuttavia, i campioni di tampone nasale e orale conservati in un dispositivo speciale, il mezzo di trasporto virale (VTM), devono essere sempre conservati a bassa temperatura, quindi il processo di trasporto del campione deve essere molto attento.Pertanto, i campioni di saliva possono essere portati da tutte le regioni dell'Indonesia nelle grandi città senza la necessità di una certa temperatura.Ciò può supportare una distribuzione uniforme della capacità di ispezione COVID-19, che è stata disuguale tra grandi città e piccole città, Java e al di fuori di Java.In conclusione, questa ricerca mostra che la saliva può essere utilizzata per i test COVID-19 basati sulla PCR perché la raccolta di questi campioni si è rivelata facile da eseguire, riducendo al minimo il disagio, sia negli adulti, nei bambini che nei pazienti con malattie delle vie respiratorie superiori.Ci auguriamo che gli esami di routine utilizzando il metodo della PCR salivare possano essere applicati in modo uniforme in tutta l'Indonesia per controllare il picco nei casi positivi che si sono verificati negli ultimi due mesi.Sheila Jonnatan, laureata in biotecnologie presso l'Università Cattolica Atma Jaya dell'Indonesia;Tria A. Widowati, laurea in biologia presso l'Università dell'Indonesia;e Helen Kristin, laurea in biologia presso la Eleven Maret University;coinvolti in questa ricerca e hanno contribuito alla stesura di questo articolo.Scrivi un articolo e unisciti a una comunità in crescita di oltre 149.700 accademici e ricercatori provenienti da 4.433 istituzioni.Copyright © 2010–2022, The Conversation US, Inc.